2016年11月，中共中央辦公廳、國務院辦公廳聯合印發《關于全面推行河長制的意見》（以下簡稱《意見》），要求以保護水資源、防治水污染、改善水環境、修復水生態為主要任務，全面建立省、市、縣、鄉四級河長體系，構建責任明確、協調有序、監管嚴格、保護有力的河湖管理保護機制，為維護河湖健康生命、實現河湖功能永續利用提供制度保障。《意見》印發后，水利部會同有關部門和地方積極采取措施，切實抓好貫徹落實工作，確保《意見》落地生根、取得實效。
一是加大宣貫力度。《意見》向社會公開后的次日，按照中宣部的統一安排，水利部會同有關部門配合國務院新聞辦公室舉辦了新聞發布會，從《意見》出臺的背景和意義、主要任務和要求、保障措施和監督考核等方面系統介紹了《意見》有關情況，并回答了媒體記者的提問。同時，配合新華社、中央電視臺等有關媒體做好系列宣傳報道，利用手機客戶端、微博、微信等新媒體，深入解讀《意見》，廣泛宣傳河長制的重大意義、地方探索實踐的經驗和成效等，為河長制的實施創造良好的輿論氛圍。
二是制定實施方案。水利部聯合有關部門印發了《貫徹落實<關于全面推行河長制的意見>實施方案》（水建管〔2016〕449號），進一步細化實化河長制工作目標和主要任務，明確了時間表、路線圖和階段性目標。要求各地抓緊編制工作方案，重點做好確定河湖分級名錄、明確河長制辦公室、細化實化主要任務，強化分類指導，力爭2017年底前各省（區、市）出臺省級工作方案。要求各地建立健全河長制工作機制，制定出臺河長會議、信息共享、考核問責與獎勵等制度，明確工作人員，強化監督檢查，嚴格考核問責，加強經驗總結推廣和信息公開。要求各地加強組織領導，強化部門聯動，統籌流域協調，落實經費保障，加強宣傳引導，扎實做好全面推行河長制工作，確保到2018年年底前，全面建立省、市、縣、鄉四級河長體系。
三是進行動員部署。水利部聯合有關部門召開視頻會議，就貫徹落實《意見》進行了動員部署。水利部部長陳雷系統闡述了全面推行河長制的重要意義，強調各地要結合本地實際，全面抓好《意見》貫徹落實各項工作，抓緊制定實施方案、落實組織機構、建立健全配套制度、完善長效管理機制、嚴格責任考核追究以及抓好宣傳引導。江西、江蘇等省（區、市）就推行河長制的主要做法作了交流發言。會議明確了全面推行河長制工作時間進度安排和階段性目標，要求水利部會同有關部門建立部門協調機制，強化組織指導和監督檢查，適時開展總結評估工作，確保河長制落實落地。
四是健全工作機制。水利部迅速成立了由主要負責同志擔任組長的推進河長制工作領導小組，建立部領導牽頭、司局包省、流域機構包片的督導檢查機制，切實指導和督促各地做好河長制工作。同時，制定印發了《關于建立河長制工作進展情況信息報送制度的通知》（辦建管函[2017]18號），要求自2017年起，各省（自治區、直轄市）河長制辦公室每兩月報送貫徹落實進展情況。
五是加強工作指導。水利部認真總結了已全面推行河長制的8個省（市）在實施過程中的主要做法和經驗，通過座談會等形式進行了宣傳推廣，供其他地區學習借鑒。積極指導和督促各級水行政主管部門制定推行河長制的實施方案，部分地區先行先試，取得了階段進展，如上海市編制了《關于本市全面推行河長制的實施方案》，已經市委全面深化改革小組審議通過；水利部太湖流域管理局制定印發了《關于推進太湖流域片率先全面建立河長制的指導意見》等。
下一步，水利部將進一步加大工作力度，會同有關部門好地方深入做好《意見》貫徹落實工作。一是建立全面推行河長制工作部際協調機制，指導各省（自治區、直轄市）全面推行河長制，協調解決河長制推行中的重大問題。二是及時跟蹤了解各地河長制工作進展情況，并做好經驗總結推廣工作。三是將河長制工作納入最嚴格水資源管理制度考核，以考核促落實。
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